马克思主义理论与思想政治教育专业是1996年教育部修订研究生专业目录后出现的一个新的专业名称。在此之前，本科生专业目录中有思想政治教育专业，研究生专业目录中也有思想政治教育专业，两者是一致的；1996年以后，本科生专业目录中仍然保留着“思想政治教育专业”，而研究生专业目录中的思想政治教育专业被改为马克思主义理论与思想政治教育专业，两者出现了不一致。